
檢測基因范圍:靶向 523 個基因,可評估所有 DNA 和 RNA 變異類型,包括單核苷酸變異(SNV)、拷貝數(shù)變異(CNV)、插入缺失(Indel)、融合,同時涵蓋微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(MSI)和腫瘤突變負荷(TMB)的檢測,能全面解析腫瘤相關基因信息。
樣本類型與用量:適用于 FFPE 組織樣本,DNA 用量為 40 ng,RNA 用量為 40 - 80 ng,對珍貴的腫瘤樣本具有較好的兼容性。
測序深度與靈敏度:通過 “超覆蓋度探針" 設計,確保低頻突變區(qū)域測序深度達 1000× 以上。針對 0.5% 等位基因頻率的 KRAS G12D 突變,檢出率高達 98% ,且假陽性率<0.1%;對腫瘤組織樣本中 0.1% 的低頻突變,當測序深度達 5000× 時,檢出率仍保持 90% 以上,能精準捕獲腫瘤異質(zhì)性中的低頻突變信息。
測序平臺兼容性:可在 NovaSeq X 系列、NextSeq 1000 系統(tǒng)、NextSeq 2000 系統(tǒng)等多種 Illumina 主流測序平臺上使用,支持靈活的實驗規(guī)模選擇。在 NextSeq 1000 和 NextSeq 2000 系統(tǒng)上,每次運行可處理 8 - 36 個樣本;在 NovaSeq 6000 系統(tǒng)上,可處理 16 - 192 個樣本;在 NovaSeq X 系列上,可處理 32 - 960 個樣本 。
數(shù)據(jù)產(chǎn)出時間:從樣本到結(jié)果僅需 4 - 5 天,通過手動或自動化工作流程,結(jié)合即用型 Dragen 二次分析流程,可快速獲取檢測結(jié)果 。
配套分析軟件:配套 Illumina Local Run Manager 軟件搭載 “腫瘤專用堿基識別模型",對 InDel 類型突變的識別準確率較傳統(tǒng)算法提升 30%,可有效區(qū)分真實突變與測序誤差。
文庫制備方法:采用機械 DNA 片段化和接頭連接的方式,無需 PCR 擴增,避免了 PCR 擴增引入的偏差和錯誤,能更真實地反映基因組信息。
樣本類型與用量:適用于全基因組測序,推薦樣本為 DNA,用量為 1 μg 。
測序覆蓋度與質(zhì)量:在測序挑戰(zhàn)性區(qū)域(如 GC 富集區(qū)、啟動子和重復區(qū)域)具有覆蓋能力,能提供高質(zhì)量的基因組覆蓋,減少文庫偏差和缺口,數(shù)據(jù)質(zhì)量高,可實現(xiàn)全基因組的變異檢測,為深入的基因組分析提供可靠數(shù)據(jù) 。
實驗時間:總檢測時間為 5 小時,其中手動操作時間為 4 小時,實驗流程相對簡潔高效。
通量選擇:有多種通量選擇,帶單索引的試劑盒支持 24 個樣本的手動低通量研究;帶 96 個 CD 索引的試劑盒支持 96 個樣本的高通量研究,且可在液體處理機器人上實現(xiàn)自動化操作(也可手動處理);IDT for Illumina 雙(UD)索引(24 或 96)可提高樣本復用率,實現(xiàn) reads 的準確分配和流動池的高效利用 。
適用測序平臺:支持所有 Illumina 測序儀器,可根據(jù)實驗需求靈活選擇合適的測序平臺,滿足不同規(guī)模的研究需求。
測序平臺特性:專為 NextSeq 550 系統(tǒng)設計,該系統(tǒng)具備高靈活性和廣泛的應用范圍,可開展從 mRNA - seq 到外顯子組測序等多種應用 。
試劑性能提升:v2.5 版本的試劑采用了優(yōu)化的流動池,能維持起始熒光強度,在整個運行過程中性能更穩(wěn)定,可承受更高的濕度、溫度以及更長時間的儲存,同時延續(xù)了 v2 試劑和緩沖液墨盒的高精度特性 。
測序數(shù)據(jù)產(chǎn)出:高輸出試劑盒的輸出量可達 120 GB(300 - cycle 高輸出試劑盒)、60 GB(150 - cycle 高輸出試劑盒);中輸出試劑盒的輸出量可達 39 GB(300 - cycle 中輸出試劑盒)、19.5 GB(150 - cycle 中輸出試劑盒) 。高輸出試劑盒每運行一次最多可產(chǎn)生 400 M 個簇,中輸出試劑盒最多可產(chǎn)生 130M 個簇,能滿足不同深度的測序需求 。
樣本兼容性:兼容 DNA 和 RNA 樣本,可進行雙端測序、測序控制、簇生成以及基于合成的測序,還配備了 PhiX v3 作為測序?qū)φ?,確保測序過程的準確性和可靠性 。
數(shù)據(jù)穩(wěn)定性:試劑盒采用射頻識別(RFID)編碼耗材,可確保試劑的可追溯性和兼容性,有效提高實驗數(shù)據(jù)的穩(wěn)定性和可重復性。
檢測對象與樣本類型:用于對血漿中的循環(huán)腫瘤 DNA(ctDNA)進行全面基因組分析,樣本僅需 4 ml 血漿,從中提取 20 ng 的 cfDNA ,實現(xiàn)了對腫瘤的微創(chuàng)檢測。
檢測靈敏度與特異性:基于 UMI 的雜交捕獲文庫制備和深度測序技術,對單核苷酸變異(SNV)的檢測靈敏度可達 0.2% VAF,分析靈敏度≥95%(小變異,≥0.5% VAF),分析特異性≥99.995%(小變異,≥0.5% VAF) ,能精準檢測血漿中微量的腫瘤相關基因突變。
檢測基因范圍與內(nèi)容:靶向 523 個基因,可評估主要變異類型的 DNA 變異(如 SNV、MNV、Indel、CNV 和基因重排),同時涵蓋關鍵的免疫腫瘤基因特征(TMB、MSI),為腫瘤的精準診斷和免疫治療方案的制定提供全面依據(jù) 。
實驗流程與時間:從純化核酸到變異報告僅需 3 - 4 天,文庫制備可在一天內(nèi)完成,采用化學技術和便于自動化的試劑盒及方法,大大縮短了檢測周期。配合 Dragen 二次分析,可在本地或云端快速進行變異調(diào)用 。
測序平臺兼容性:與 NovaSeq 6000(NovaSeq 6000Dx 研究模式)和 NovaSeq X 系列兼容,提供靈活的測序選擇。在 NovaSeq X 系列上,運行時間縮短近 40%,批次規(guī)模更靈活(4 - 48 個樣本) 。
